Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfascQ810U3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfascQ810U3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms