Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZF2

Ifne, Interferon epsilon, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfneQ80ZF2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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IfneQ80ZF2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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IfneQ80ZF2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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IfneQ80ZF2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IfneQ80ZF2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms