Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp8Q80YR6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms