Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrfn4Q80XU8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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