Protein–RNA interactions for Protein: Q80X59

Tmco5b, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5bQ80X59 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmco5bQ80X59 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5bQ80X59 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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