Protein–RNA interactions for Protein: Q80W22

Thnsl2, Threonine synthase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thnsl2Q80W22 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Thnsl2Q80W22 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms