Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ell3Q80VR2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ell3Q80VR2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms