Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc1Q80VQ1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms