Protein–RNA interactions for Protein: Q80UY2

Kcmf1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcmf1Q80UY2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcmf1Q80UY2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcmf1Q80UY2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms