Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cul9Q80TT8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cul9Q80TT8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms