Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf8Q80TJ7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf8Q80TJ7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf8Q80TJ7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf8Q80TJ7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf8Q80TJ7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf8Q80TJ7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms