Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdc42bpbQ7TT50 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms