Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo2Q7TSY8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms