Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcdh8Q7TSK3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcdh8Q7TSK3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcdh8Q7TSK3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcdh8Q7TSK3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcdh8Q7TSK3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcdh8Q7TSK3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms