Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms