Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Actn1Q7TPR4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms