Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms