Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp3Q7TNH6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nphp3Q7TNH6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nphp3Q7TNH6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Nphp3Q7TNH6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nphp3Q7TNH6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nphp3Q7TNH6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nphp3Q7TNH6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nphp3Q7TNH6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Nphp3Q7TNH6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nphp3Q7TNH6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nphp3Q7TNH6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms