Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg2Q7TMS5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms