Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Uhrf2Q7TMI3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf2Q7TMI3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms