Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snd1Q78PY7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms