Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1cQ76I25 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms