Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Topbp1Q6ZQF0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms