Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot1Q6ZQ08 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms