Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms