Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms