Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms