Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timd4Q6U7R4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms