Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja6Q6S5G4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms