Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms