Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131 ms