Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms