Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gramd2bQ6PEM6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms