Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtifQ6PEE2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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