Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd4Q6PDQ2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms