Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms