Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms