Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Z1

Smarcd3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd3Q6P9Z1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms