Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp49Q6P9L4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms