Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsen2Q6P7W5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms