Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gga2Q6P5E6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms