Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Podnl1Q6P3Y9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Podnl1Q6P3Y9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Podnl1Q6P3Y9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Podnl1Q6P3Y9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Podnl1Q6P3Y9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Podnl1Q6P3Y9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Podnl1Q6P3Y9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Podnl1Q6P3Y9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Podnl1Q6P3Y9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Podnl1Q6P3Y9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Podnl1Q6P3Y9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Podnl1Q6P3Y9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Podnl1Q6P3Y9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Podnl1Q6P3Y9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Podnl1Q6P3Y9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Podnl1Q6P3Y9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms