Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frg2f1Q6P3A2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frg2f1Q6P3A2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms