Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm2bQ6P1G2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm2bQ6P1G2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm2bQ6P1G2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm2bQ6P1G2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm2bQ6P1G2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm2bQ6P1G2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm2bQ6P1G2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm2bQ6P1G2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm2bQ6P1G2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm2bQ6P1G2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm2bQ6P1G2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm2bQ6P1G2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm2bQ6P1G2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm2bQ6P1G2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm2bQ6P1G2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm2bQ6P1G2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm2bQ6P1G2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm2bQ6P1G2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm2bQ6P1G2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm2bQ6P1G2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm2bQ6P1G2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm2bQ6P1G2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm2bQ6P1G2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2bQ6P1G2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms