Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig3Q6P1C6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms