Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Asic1Q6NXK8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms