Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms