Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd11Q6NS46 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms