Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm4Q6IRU2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm4Q6IRU2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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