Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms